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SyntenyMiner

SyntenyMiner r.0001-11272006

SyntenyMinerは、複数の完全なゲノム配列間の比較を視覚化し、尋問するためのアプリケーションです。インタフェースは、参照ゲノム配列との一致の航行ビューを提供します。シーケンスは、異なるゲノムの染色体間の一致、さらに逆位、挿入/欠失、および転座などの大型の両方小規模ゲノムrearragementsを明らかに、ドットプロットのコンテキストで検査することができます。...

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mpiBLAST

mpiBLAST 1.4.0-pio / 1.5.0 Beta 1

mpiBLASTは、NCBI BLASTのMPIベースの並列実装です。プロジェクトはのformatdbを交換し、インストールMPIとコンピュータのクラスタ上で並列にBLASTのジョブを実行バージョンでblastallがプログラムのペアで構成されます。伝統的なBLAST対mpiBLASTを使用するには、主に2つの利点があります。まず、mpiBLASTは、クラスタ内の各ノード全体でデータベースを分割します。データベースの各ノードのセグメントは小さいので通常は原因ディスクの消去I /...

Adun

Adun 0.8.2

Adunプロジェクトは、データ管理および分析機能を備え、拡張可能な生体分子シミュレーションプログラムです。Adunは、直感的なユーザーインターフェイスからだけでなく、より柔軟なプログラム·レベルからアクセスすることができる分子シミュレーションのための高度なアルゴリズムとプロトコルを提供します。これは、シミュレーションを作成し、操作するための強力なライブラリですAdunフレームワーク上に構築されています。しかし、それだけでその能力を容易に拡張を可能にするメカニズムを提供するものとしてシミュレーションデータas...

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バイオインフォマティクスベンチマークシステムは、そのシステムの性能を調査するために、エンドユーザーやベンダーを有効にするために、合理的なテストフレームワーク、テスト、およびデータを構築しようとする試みです。私たちがやろうとしていることは、テストのためのフレームワーク、およびすべてのダウンロードおよびシステム性能の特定の要素をプローブするために使用することができるテストのコアセットを作成することです。また、これらのテストのソースはGPLの下で利用可能であり、アイデアを簡単に測定やチューニングの理由で意味のある...