Adun

Adun 0.8.2

Adunプロジェクトは、データ管理および分析機能を備え、拡張可能な生体分子シミュレーションプログラムです。Adunは、直感的なユーザーインターフェイスからだけでなく、より柔軟なプログラム·レベルからアクセスすることができる分子シミュレーションのための高度なアルゴリズムとプロトコルを提供します。これは、シミュレーションを作成し、操作するための強力なライブラリですAdunフレームワーク上に構築されています。しかし、それだけでその能力を容易に拡張を可能にするメカニズムを提供するものとしてシミュレーションデータas...

AREM

AREM 1.0.1

AREMは(チップ、配列データのモデルベース分析)MACSに基づいています。クロマチン免疫沈殿(チップSEQ)に結合されたハイスループットシークエンシングが広くゲノムワイドな転写因子、補因子、クロマチン修飾剤、および他のDNA結合タンパク質の結合パターンを特徴付けるに使用されます。 ChIPの-、配列データ分析の重要なステップは、参照ゲノムに短いハイスループット配列決定から読み取るマップと短い読み取りで強化されたピーク領域を同定することです。いくつかの方法は、チップ -...

バイオインフォマティクスベンチマークシステムは、そのシステムの性能を調査するために、エンドユーザーやベンダーを有効にするために、合理的なテストフレームワーク、テスト、およびデータを構築しようとする試みです。私たちがやろうとしていることは、テストのためのフレームワーク、およびすべてのダウンロードおよびシステム性能の特定の要素をプローブするために使用することができるテストのコアセットを作成することです。また、これらのテストのソースはGPLの下で利用可能であり、アイデアを簡単に測定やチューニングの理由で意味のある...

CaPSID

CaPSID 1.4.3

人間のゲノムおよびトランスクリプトーム内および特性照会し、拡張性の高い結果データベースと管理のためのユーザーフレンドリーなウェブベースのソフトウェア·アプリケーションと一緒に、カプシドは、包括的なオープンソースの病原体配列同定&NBSP用の高性能計算のパイプラインを統合したプラットフォームですし、結果を可視化する。ののはじめにあなたは、Pythonの2.6+インストールおよびApache Tomcat 6+をMongoDBのデータベースが必要になります。詳細については、wikiを読んで: ...