新しい バイオインフォマティクス のために Linux

このシールは、Hadoopの上の配列アラインメントを提供するPythonモジュールである。シールは、生物学的な配列アラインメントのためのMapReduceのアプリケーションです。 Pydoop（http://pydoop.sourceforge.net）、HadoopのためのPythonのMapReduceとHDFS APIを介してのHadoop（http://hadoop.apache.org）上でそれを実行ます。 の要件の ...

avalanchetoolboxは、神経雪崩のような分岐プロセスを識別し、記述するためのツールボックスです。 の要件の：ます。 ...

Murkaは、ユーザーが簡単に単に中央ネットワークを使用することにより、系統の問題を解決するのに役立つ無料、クロスプラットフォーム、オープンソースのコマンドラインソフトウェアです。それは、ヒューリスティックな方法、正確なアルゴリズムと同様に、シュタイナー問題解決を含んでいます。Murka＆rsquo; sの入力は可逆とアライメントstepmatrix、および出力の提供（サブ）最適な木と、それらのいくつかの組み合わせを提供します。ソフトウェアは、LinuxおよびMicrosoft...

HTSeqは、ハイスループットシークエンシング（HTS）アッセイからのデータを処理し、分析するためのPythonのフレームワークです。 の要件の：ます。 <...

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edittagは、編集メトリック配列タグのセットを設計する編集メトリックにフォメーションのための配列タグをチェックして、プラットフォーム固有のシークエンシングアダプターとPCRプライマーに配列タグを統合するためのアプリケーションのコレクションです。 edittagは他のアプローチとは異なります。＆NBSP; * edittagはマルチプロセッシングを使用して、合理的な時間枠で編集メトリック配列タグの任意の長さを生成し、とをタップ; *...

VULCANプロジェクトは、計算流体力学解析を提供します。VULCAN（複雑なフロー分析のための粘性風上アルゴリズム）は、シリアルおよびパラレル計算のさまざまなプラットフォーム上のフローを反応させ、非反応極超音速乱を通して亜音速のための計算流体力学を提供しています。推進フロー分析の計算コストは​​、楕円空間マーチングスキームのための特別な乱壁トリートメント、マルチグリッド法を使用することにより低減され、支配方程式のコンディショニングは、数値の剛性を低減させる。物理モデリング機能は、圧縮率、レイノルズ応力の異...

seriesoftubesのSolexaチップ-seqのデータの拡張パイプラインである。パッケージのドキュメント ...

reciprocal_smallest_distanceは、グローバル配列アラインメントと配列間の最大尤進化距離を正確にゲノム間の相同分子種を検出するために使用してペアワイズオルソロジーアルゴリズムです。のtarアーカイブからのインストールのダウンロードして、githubのから最新バージョンを解凍します：CD〜カール-L...

makeに似たシステムを構築し、頻繁に例えば複雑なワークフローを作成するために使用されているバイオインフォマティクスにおける＆NBSP; snakemakeは一緒に、高速で快適な実行環境で、Pythonのスタイルで清潔でモダンドメイン固有の仕様言語（DSL）を提供することで、ワークフローを作成するの複雑さを軽減することを目指しています。インストールの - ...