MultiDendrograms

MultiDendrogramsは、オープンソースライセンスの下で配布、実際のデータの階層的クラスタリングを行うためのシンプルで強力なアプリケーションです＆NBSP;距離（または重み）から出発行列、MultiDendrogramsは、最も一般的な凝集型階層クラスタリングアルゴリズムを使用して、その系統樹を計算します、グラフ表示パラメータの多数の調整を可能にし、その結果を簡単にファイルにエクスポートすることができます。特性の概要：
- マルチプラットフォーム：Javaで開発されたが、すべてのオペレーティングシステム（例：Windows、Linux、およびMacOSの）で実行されます。
- グラフィカル·ユーザー·インターフェース：データ選択、階層的クラスタリングのオプション、樹状図の表現パラメータ、樹状図全体のナビゲーション、偏差を測定します。
- 階層的クラスタリングアルゴリズム実装：可変グループシングルリンケージ、完全リンケージ、重みなし平均、加重平均、重みなし重心、加重重心と共同間-以内。
- 表現パラメータ：サイズ、向き、ラベル、軸、等
- 偏差対策：コーフェン相関係数、正規化平均二乗誤差と正規化平均絶対エラーが発生しました。
- エクスポート：ultrametricマトリックス、テキストおよびNewickのツリー形式で樹状図の詳細を表示します。
- プロット：JPG、PNGやEPS形式で樹状図の画像。
MultiDendrogramsは、可変基は、標準的なペアグループのアルゴリズムと実装に見られる非一意性の問題を解決するためのアルゴリズムで実現します。この問題は、異なるクラスタ間の2つまたはそれ以上の最小距離が融合プロセスの間に等しい場合に生じます。標準的なアプローチは、ペアを選択する距離との関係を破壊することからなる、最終階層的な分類が得られるまで、同じように進行します。しかし、別のクラスタリング（通常ペアはただランダムに選択されます！）の関係を破壊するために使用される基準に依存して可能です。
可変グループアルゴリズム群multidendrogramと呼ばれるグラフィカルな表現を生み出して絆が発生し、同時に二つ以上のクラスタ。彼らの主なプロパティは次のとおりです。
- 何のつながりがない場合、可変基アルゴリズムは、ペアグループのものと同様の結果を与えます。
- 彼らは常に一意に決定溶液を得ました。
- 結果を得るためにmultidendrogram表現では、1つは、明示的に凝集プロセスの間の関係の発生を観察することができます。また、任意の融合間隔（プログラム内のバンド）の高さは、対応するクラスタ内の不均一性の程度を示します。

要件：ます。

のJava 2 Standard Editionのランタイム環境