PrimerPlex

PrimerPlexは、マルチプレックスアッセイ用のオリゴを設計するための効率的で洗練されたツールです。マルチプレックスアッセイは、単一の反応容器で複数のターゲットの増幅を容易にし、実験の時間とコストの両方を削減します。 PrimerPlexは、マルチプレックスPCRアッセイ用およびLuminex 100、Luminex 200およびBio-Plex 200などのサスペンションアレイベースのシステム用のオリゴを設計します。このようなシステムは、96ウェルフォーマットでの多重核酸検出のための汎用プラットフォームを提供します。 PrimerPlexは、ダイレクトハイブリダイゼーションアッセイ用の特異的キャプチャープローブと、アレル特異的PCRエクステンション（ASPE）アッセイ用のプライマーを設計しています。
マルチプレックスアッセイは、遺伝子発現解析（ゲル電気泳動を使用するエンドポイント検出）、および遺伝子タイピング、病原体検出、ストレインタイピング、およびハプロタイプなどのハイスループットSNPアプリケーションに使用されます。特異性を確実にするために、BLAST検索によって同定された相同性領域を避けてオリゴを設計する。 PrimerPlexはオリゴの交差反応性をチェックし、Tmミスマッチを最小限に抑えて、可能な限り最高のマルチプレックスセットを提供します。このプロセスでは、数百万の可能なマルチプレックスプライマーセットを数秒で分析し、代替セットのリストも提示します。

このリリースの新機能：

バージョン2.72の新機能：

最新のNCBI-BLASTゲノムデータベースの変更点と、

バージョン2.70の新機能：

アップグレードには、最新のゲノムデータベースが利用できます。これは、NCBI-BLASTでのゲノムデータベースの変更に対応しています。 NCBI BLASTサーバーで報告された問題を修正しました。