このFlexSが他方に対して配位子の一つのコンフォメーションおよび配向を予測する。 FlexSで参照リガンドは剛体であると仮定され、従って、それが結合した状態に類似しているコンホメーションで与えられるべきである。 FlexSにおける重ね合わせアルゴリズムは少しだけ手動の介入が必要です。あなたは、手動でシングルステップを実施することによりFlexSでの計算にこの知識を統合することができます。したがって、FlexSリガンド対上ならびにリガンドベースの仮想スクリーニングのためのインタラクティブな作業用に設計されている。 FlexSの2主な用途は、リガンドスーパーポジショニング(例。CoMFA法/ QSAR用)と仮想スクリーニングである。あなたは、タンパク質とそれに結合する小分子(いわゆるリファレンス - リガンド)が、タンパク質の無い構造を持っている場合は、活性部位の負の指紋などの参照構造を取ることができます。 FlexSは、それらを整列させることによって、テストおよび参照構造間の類似性を決定します。仮想スクリーニングでは、参照リガンドと化合物のセットを持っていて、実験的試験のための化合物の優先順位付けに興味を持ってます。
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