関数lsimは、巨大分子の電子密度を重畳し、構造的な類似性スコアを計算します。その計算は、比較される分子のサイズに伴って直線的に拡張します。
関数lsimアラインメントは、生化学的、構造要素と概念的に無関係であり、したがって、構造のみのタンパク質の類似研究のために、公正かつ適切です。
インストール:
配布ファイルを解凍します。
タール-xzvf関数lsim-linux.tar.gz
ファイルのディレクトリに移動します。
CDのlsim.1.0.0
コピー、移動、またはリンクする実行可能ファイルの関数lsimを適切な場所に - そして関数lsimは、例えば、PATH環境variable-を通じてアクセス可能であることを確認してください。
CP関数lsimは/ usr / local / binに
例えば、選択された関数lsimディレクトリを指すように変数LSIMDIRを設定します。
のsetenv LSIMDIR /home/olaguer/progs/lsim.1.0.0ます。
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20 Feb 15
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