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バージョン: 0.57
日付のアップロード: 14 Apr 15
ライセンス: 無料
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PANAMAは、Pythonで書かれたeQTL研究、に交絡因子を考慮するために新たな確率モデルである。
そのような非観測共変量または未知の微妙な環境の摂動として隠し交絡因子は、スプリアス虚偽の関連付けを作成したり、実際の遺伝的関連信号をマスクすることができます。以前の方法とは対照的に、パナマは著名な遺伝的調節剤の効果と共同で隠された要因を学習します。結果として、この新しいモデルは、より正確に交絡変化から真の遺伝的関連の信号を区別することができる。
N. FUSI、O。 StegleとNDローレンスは、2012年、PLoSの計算生物学」の交絡因子と著名な遺伝的規制当局の共同モデリングが増加遺伝ゲノミクス研究の精度を提供しています」
ではより多くの情報http://ml.sheffield.ac.uk/qtl/panama.html
Requirements:
- Python
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