SeedWaterSegmenter

SeedWaterSegmenterは、グラフィカルなPythonツールですへ対話的にセグメント画像エッジ·ラベルを持つ組織内の細胞のスタック＆NBSP（別名白い輪郭。）;相互作用は完全に順番に流域によって展開されている種子の編集に基づいているアルゴリズム。 SWSと他のツールと​​の主な違いは、あなたが困難なセルの境界を調整することに役立つことができる細胞ごとに複数のシードを置くことができるということです。
SWSはwxPythonをの上、matplotlibの、numpyの、scipyのダウンロード、およびmahotas上に構築されています。
その中核には、それが電光石火の流域アルゴリズム（mahotasプロジェクトのおかげで）を使用し、リアルタイムの更新を可能にします。これは、単純な（雑然とした場合）のUIを持って、さらには1レベルのアンドゥを含め、完全にインタラクティブです。
すべてのこれらの詳細を提供し、サイトメトリパートAでよりSWS約出版物：
http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/cyto.a.22034/​​abstract
ソースコードは4リポジトリにし、PyPIのにミラーリングされています。
- GitHubの：http://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/
- Bitbucketの：http://bitbucket.org/davidmashburn/seedwatersegmenter
- Gitorious：http://gitorious.org/seedwatersegmenter
- グーグルコード：http://code.google.com/p/seedwater/
- PyPIの：http://pypi.python.org/pypi/SeedWaterSegmenter
Google Codeのページには、32ビットWindowsまたは64ビットLinux上で動作するはずですいくつかのバイナリーリリース（http://code.google.com/p/seedwater/）を持っていますが、これらは今古いです。今 "easy_installを"メソッドを使用してください。
SeedWaterセグメンタV XX Manual.txt：詳細については、あなたはまた、マニュアルを読むことをお勧めします20XX.txt Pythonがインストールの手順を参照してください。
ののインストールと実行
インストールは最終的に簡単です！
実際には、次のことが可能になりました "easy_installをSeedWaterSegmenter」
クイック手順：
Windowsの/ Macの場合：
＆NBSP; Enthought Pythonディストリビューションhttp://www.enthought.com/products/edudownload.phpをインストール
Ubuntuの/ Debianの：
＆NBSP;須藤はapt-getののpython-setuptoolsのののpython-wxtoolsをインストールするのpython-numpyののpython-scipyのダウンロードのpython-matplotlibののpython-イメージングのpython-XLRDのpython-xlwt
CMDウィンドウ（Windows Vista / 7の下に管理者として実行する必要があります）またはターミナル（Mac用/ Linux）のでは、実行します。
＆NBSP; easy_installをmahotas cmpGen EllipseFitter FilenameSort GifTiffLoader ImageContour SeedWaterSegmenter
詳しい使い方：
最新バージョンが呼び出されます。
「Pythonは手順8月の2012.txtをインストールする」
https://github.com/davidmashburn/SeedWaterSegmenter/blob/master/Pythonインストール手順月2012.txt

の要件の

< LI>のPythonます。