STEPS

STEPS任意に複雑な3Dジオメトリにおける反応拡散シス​​テムの正確な確率的シミュレーションのためのパッケージです。当社のコアシミュレーションアルゴリズムは、3D四面体メッシュの要素の上に分子の拡散に対処するように拡張、ガレスピーのSSAの実装です。
それは主に、樹状突起およびシナプスの周囲のニューロンのシグナル伝達経路の詳細なモデルをシミュレートするために開発されたが、それは一般的なツールであり、空間的変化および形態が役割を果たしていると考えられている任意の生化学的経路を研究するために使用することができる。
私たちは、STEPSのユーザーは、モデルを設定するメッシュを生成し、シミュレーションと生成を制御し、出力を分析するのすべての側面を制御するためのPythonスクリプトを使用できることを意味し、PythonモジュールのセットとしてSTEPSを実施しています。コアの計算ルーチンがまだ実行の最大速度のためのC / C ++拡張モジュールとして実装されています。
ステップはGPL v3のライセンスの下で配布されます。

の要件の：ます。

• のPythonます。