ZOOM Lite

ZOOM Liteは、次世代シーケンシングデータのマッピングと可視化ソフトウェアです。ユーザー入力基準ゲノムとイルミナ/ Solexa短いファイルを読み取るか、またはABソリッドカラースペースは、.fasta *として、さまざまな形式のファイルを読み込み、* .fastq、* _seq.txt、* .csfastaなどZOOMはこれらの短いのマッピング結果を出力参照配列に読み込みます。 ZOOM Liteは、新たに設計された複数の離間した種子の理論に基づいて、高速で正確なマッピングカーネルを持っています。シングルエンドおよびペアエンドの両方が15bpから240bpに様々な長さの読み取り処理することができます。ミスマッチとリードし、参照配列上の標的領域との間の様々な長さの1つの挿入/削除の任意の数が許可されています。一意にマッピングされた結果や最高（トップN）、各読み取りの結果は、最小限のミスマッチとインデル長さに応じて報告されます。品質スコアは、マッピング精度を向上させるために利用されます。マッピング·カーネルに基づき、ZOOM Liteは、ユーザは、ローカルリードデータと参照配列データを読み込むまでの4つのCPU間で並行して適切なパラメータ、プロセス大量のデータを選択し、実行中のタスクを監視し、マッピング結果を保存することを可能にするのグラフを表示しますマッピングの結果、さらにUCSCブラウザトラック情報と測量のための* .BEDまたは* .GFFファイル形式のいずれかで出力マッピングの結果。マッピング結果の読み取りの間に詳述配列アラインメントに染色体全体にわたって読み取り深度グラフから、任意のスケールで表示および参照配列することができます。ユーザーが簡単に、単純にクリックしてドラッグやスクロールを介して関心領域に移動します。 ZOOM LiteはZOOM Studioソフトウェアの誘導体である

このリリースで新しい何が：

このバージョン1.5は、アーキテクチャは、より良いコードの最適化、より小さなプログラムのバイナリサイズ、およびアップグレードdabaseを調整し、SAMのエクスポート形式を備えてパフォーマンスを向上させるためenginingます。