Tinker

Tinker 6.2.04

ティンカーは生体高分子のためのいくつかの特別な機能で、分子力学と動力学のための完全かつ一般的なパッケージです。 TINKERは、アンバー(ff94、FF96、ff98、FF99、およびff99SB)、CHARMM(19、22、および22またはCMAP)、Allinger...

単位スカウトは、(このような「100PSIの*のFT ^ 2 'のような)ユニット式の用語で記述計算を理解し、デフォルトまたはユーザによって指定された他のすべての単位当たり、SI単位に変換します。ユーザーインターフェイスは必要ありません。エディタ、ブラウザ、スプレッドシート -...

この簡単なプロモーター予測プログラムは、真核生物遺伝子プロモーターのコア領域を同定するためのツールである。これは、全ゲノムのコンテキストでこれらの領域を検出するために、プロモーターの普遍的な性質を使用しています。簡単なプロモーター予測プログラムは抗議からヒトに至るまで、いくつかの真核生物でテストされています。人間には、現時点で、最高のパフォーマンスツールは、転写開始に関連付けられている領域を同定するために、である。事前に計算されたモデルを使用していない場合にのみ、一度に完全なゲノム上で実行する必要があります...

Toxmatch

Toxmatch 1.07

このToxmatchはカテゴリに化学物質のグループ化を容易にし、読み取りを横断するためにいくつかの化学的類似性指数をエンコードし、柔軟かつユーザーフレンドリーなオープンソースソフトウェアアプリケーションである。コア機能は、様々な構造及び記述子ベースの類似度の指標、ならびにセットに化合物又は化合物の集合間の類似性ペアワイズ類似度を計算するための手段に基づいてデータセットを比較する能力が含まれる。ソフトウェアは、科学的な研究者や化学物質の毒性の評価においてコンピュータベースの推定方法の適用に興味を持つ人へのサー...

ポータブルToxmatchのカテゴリに化学物質のグループ化を容易にし、読み取り法に数化学的類似性指数を符号化し、柔軟で使いやすいオープンソースのソフトウェアアプリケーションです。コア機能は、様々な構造及び記述子ベースの類似度の指標、ならびにセットに化合物又は化合物の集合間の類似性ペアワイズ類似度を計算するための手段に基づいてデータセットを比較する能力が含まれる。ソフトウェアは、科学的な研究者や化学物質の毒性の評価においてコンピュータベースの推定方法の適用に興味を持つ人へのサービスとして自由に利用できるように...

Chemked-I

Chemked-I 5.0

Chemked-Iは、気相化学的に反応するシステムをシミュレートするために設計されたプログラムです。種との反応の速度定数の熱力学的関数を計算するためのパラメータのセットがデータベースに収集される。あなたは、ソート、データを編集し、特定のプロパティを持つ種との反応を選択して、別のデータベースからデータを移動することができます。プログラムは、データをチェックし、問題がある場合は、エラーメッセージが表示されます。...

単位変換2000を使用すると、すぐにシステムから別のシステムの測定の単位を変換することができるようになります小さなユーティリティです。施設は、様々な長さ、重さ、ボリューム、地域、密度、およびパワーとスケールの測定値に変換するために含まれています。...

このChemked-IIは、化学動力学シミュレーションの結果を表示し、分析するための多目的ポストプロセッサである。プログラム動作のために必要な情報が考慮中のデータベースから直接Chemked-Iツールによって作成されたソルバーファイルに格納されている。ソルバーファイルには、反応機構との関連熱力学的データが含まれています。これらのファイルは、所与の反応セットに対する異なる初期条件での問題を解決するためにChemkedソルバーにおいて用いることができる。結果は、ソルバーファイルからのデータを使用してChemke...