このクロマチックドットプロットは、一つのシーケンス内の高低の類似性の領域を識別し、表示するために使用される(例えば、リピートまたはタンデムリピートを散在)または2つの異なる配列間ことができる。カラーコードは、低品質の試合で飽和ため、パラメータの複数のテストと調整を必要とせずにされているドットプロットで対角線を識別することができます。...

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空間的なオーバーラップ評価者は、あなたがペア賢い空間距離に基づいて、個人の二つのグループの空間的な重なりを評価するのに役立ちますアクセス可能なツールとして開発されている。異なる生息地内の2つのマウスキツネザル種の空間的な重なりの相違を明らかにし、定量化するために母集団の遺伝的研究で使用した。これは、最近傍の定義された数の範囲内のグループ1/2に割り当てられた個人の平均数を計算します。結果の値は、2つの異なるグループの空間的な重なりの程度を示すます。...

proTRAC

proTRAC 1.0

proTRACは、確率のpiRNAクラスター検出、可視化、および分析のためのユニークで便利なツールです。 proTRACは、クラスタの検出これまで適用方法に比べて、より高い感度と選択性を示す。観察された配列の意義は、(典型的piRNAの長さの範囲内で、配列の読み取りまれにマッピングされた対応するヒット密度、ストランドバイアス、遺伝子座の量を読み取る位置10の位置1またはAでのTとの遺伝子座の量および遺伝子座の量26-...

QuickPick

QuickPick 1.0

クイックピックアップを使用すると、シーケンスの挿入を選ぶことができます簡単に使用できると便利な道具です。クイックピックアップは、センスおよびアンチセンス方向に挿入および欠失を含む5つのミスマッチまでできるようにプライマー配列を検索することにより、関係なく、連結方向の挿入物を見つけるでしょう。クイックピックアップは、注釈なしで純粋なシーケンスを含む入力、としてファイルを.SEQ受け付けます。結果ファイルには、クイックピックアップ作業ディレクトリに保存されます。...

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