pppBenchmarkは17最先端のPPPの大規模なベンチマーク調査を提供しています。多面的な評価戦略は、プロモーター予測ソフトウェアの作者が適切な方法で、既存の方法に彼らの方法を比較することができ、プロモーターの予測評価のためのゴールドスタンダードとして使用することができることが提案されている。この評価戦略は、その後、予測性能、プロモータークラス特異性、予測変数との間のオーバーラップ、および予測の片寄りが行われるに選択されたプロモーターの予測因子と深い分析を比較するために使用されます。 の要件の...
GenomeViewは、次世代のスタンドアローンゲノムブラウザとエディタです。これは、インタラクティブなシーケンスの視覚化、注釈、複数のアラインメント、合成マッピング、および短い読み取りアラインメントを提供します。多くの標準的なファイル形式がサポートされており、新しい機能は、プラグインシステムを使用して追加することができる。これは、短い読み合わせの可視化、多重アラインメントビューア、および比較ゲノミクス、既存のWebサイトおよびデータ·プラットフォームとの容易な統合、および認証と暗号化を備えています。...
この簡単なプロモーター予測プログラムは、真核生物遺伝子プロモーターのコア領域を同定するためのツールである。これは、全ゲノムのコンテキストでこれらの領域を検出するために、プロモーターの普遍的な性質を使用しています。簡単なプロモーター予測プログラムは抗議からヒトに至るまで、いくつかの真核生物でテストされています。人間には、現時点で、最高のパフォーマンスツールは、転写開始に関連付けられている領域を同定するために、である。事前に計算されたモデルを使用していない場合にのみ、一度に完全なゲノム上で実行する必要があります...
EpsGraphics出力EPSグラフィックへのJavaライブラリです。 EpsGraphicsは、Javaグラフィックスの目的であったとしてあなたはEPSファイルに描画することができますのGraphics2Dの拡張機能です。...
