CaPSID

人間のゲノムおよびトランスクリプトーム内および特性照会し、拡張性の高い結果データベースと管理のためのユーザーフレンドリーなウェブベースのソフトウェア·アプリケーションと一緒に、

カプシドは、包括的なオープンソースの病原体配列同定＆NBSP用の高性能計算のパイプラインを統合したプラットフォームですし、結果を可視化する。
ののはじめに
あなたは、Pythonの2.6+インストールおよびApache Tomcat 6+をMongoDBのデータベースが必要になります。詳細については、wikiを読んで：

• 修正：http://wiki.github.com/capsid/capsid/home

  Whatは、このリリースで新しいのですエラーメッセージの減算とアライメントを実行しているが見つからない。

• 実行時間の長いクエリを固定の詳細作業します。

のあるどのバージョン1.4.2のの新しい：

• 削除MongoKit依存関係します。

のバージョン1.4.1にの新しい何が：実行時間の長い統計クエ​​リの

• 修正カーソルのタイムアウト

のあるどのバージョン1.4.0のの新しい：

• 彼らがすべてではなく、実行されている間に追加の統計情報終わりにします。
• UIDます。
などの遺伝子に固有のIDを保存します
修正READMEます

のバージョン1.2.7でのの新機能である

のどのバージョン1.2.6のの新しいです：マップされた構築する際に、

• 減算フィルタからマップされていないと、

のバージョン1.2の新しいのは何ですか。

• マッピングされていないが、読み込みからFASTQファイルを作成するユーティリティます。
• ユーティリティFASTQファイルの交点を返すようにします。
• ユーティリティは、フィルタFASTQファイルを返すようにします。
• を追加しましmapqしきい値フラグを減算し​​ます。
• Gbloaderは現在、細菌や真菌のゲノムを読み込むことができます。
• はGridFSを使用して、データベースへのゲノム配列を保存します。

統計を計算するときに
• は
メモリフットプリントを削減
• ユースサブプロセスの代わりがos.systemの
• mapqスコアフィルタは、0 を含める必要があります

の のバージョン1.1の新機能：

• はペアエンドのサポートがします。
読み込み、追加します

のバージョン1.0.1の新機能のは何ですか。

• のMongoDB認証のサポートが追加されました。

の要件の

• のPythonます。