Expression2Kinases

ゲノムワイドなmRNAのプロファイリングは、異なる条件下での細胞の全体的な状態のスナップショットを提供します。しかし、mRNAのレベルは、上流の調節機構の直接の理解を提供していません。 Expression2Kinases（X2K）は、ゲノムワイドな遺伝子発現の観測された変化のための可能性が高い責任上流調節因子を同定するための新しいアプローチです。のChIP-seqの/チップと位置重み行列（のPWM）データ、タンパク質 - タンパク質相互作用、およびキナーゼ基質のリン酸化反応を統合することによりX2Kは、遺伝子発現のゲノム全体の差異の上流の調節機構を同定するために使用され得ます。アイデアは、これらの要因を中心に転写調節サブネットワークを構築するための追加のタンパク質を用いて同定した転写因子を接続し、最終的にキナーゼ基質を使用するタンパク質 - タンパク質相互作用を使用し、最初の遺伝子発現の差を調節する可能性が最も高い転写因子を推定することです最も可能性の高い同定の転写複合体の形成を調節する候補タンパク質キナーゼを同定し、ランク付けするタンパク質リン酸化反応、。 X2Kも濃縮が解析し、遺伝子発現の変化を逆転または悪化させることができる薬剤を予測する遺伝子のリストを実行するためのツールが含まれています。 X2Kアプローチは、アクションの細胞シグナリングとUNRAVEL薬のメカニズムの理解を進めることができます。要件：ます。

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