BioRuby

BioRubyは、バイオインフォマティクス（生物情報科学）のための統合環境を提供します。
SなどのWebサービスを含むライブラリの多種多様な、オブジェクト指向スクリプト言語Rubyは、複雑なオブジェクト、Perlの＆rsquoのように強力なテキスト処理のための正規表現を表現するために、たとえば、明確な構文、バイオインフォマティクスの研究に適した多くの機能を持っています
Rubyの構文は簡単で、非常にきれいであるように、我々はそれがソフトウェア開発者のため、初心者のために簡単に学習でき、生物学者のために使いやすく、また、十分に強力であると考えています。
BioRubyでは、開発者は、フラット・ファイル、インターネットWebサーバーとローカルリレーショナルデータベースからの生物学的データベースのエントリを取得することができます。
これらのデータベースエントリを使用すると、必要な情報を抽出するために解析することができます。生物学的配列のルビー＆rsquoの充実方法で処理することができる; sのStringクラスと正規表現を持ちます。
ライブラリは、ブラスト、FASTA、HMMERおよび生物学的分析のための多くの他のソフトウェアパッケージのようなツールと統合することができます。
 BioRubyは、主要な生物学的なデータベース形式をサポートし、フラットファイルのインデックス作成、SQL、Webサービスなど簡単にBioRubyにより利用することができKEGG APIを含む様々なWebサービスを介してそれらにアクセスするための多くの方法を提供します。

特長：ます。

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