Topographica

Topographicaは、ニューラルマップの計算モデリングのためのソフトウェアパッケージです。
オブジェクトには、科学者が感覚と運動システムを構成する地形図のレベルで脳機能を理解することです。
Topographicaは、創世記やニューロンとして利用可能である多くの良い低レベルのニューロンシミュレータを補完することを意図しています。これらのシミュレータは、ニューロンおよびそれらの小規模なネットワークの詳細な内部動作のモデル化に焦点を当てています。
Topographicaではなく、このようなニューロンの何千が接続の何百万人を含む地形図に接続している場合にのみ表示され、大規模な構造と機能に焦点を当てています。
多くの重要な現象は、二次元の視覚配向および運動方向マップを編成、およびオブジェクトセグメント化およびグループ化プロセスを含む、このような大規模なネットワークなしに研究することができません。
このようなモデルを実用的にするために、Topographicaに基本単位は、ニューロンのシートではなく、ニューロンまたはニューロンの一部です。
ほとんどのシミュレーションのために、シートは、抽象発火率または積分発火ニューロンからなる、高レベルで実現することができます。
検証のために、または特定の現象のために必要な場合には、Topographicaは簡単に他のシミュレータで、より詳細なニューロンモデルとインタフェースシートを使用して拡張することができます。
以下、詳述するシートは、例えば、一時的にも使用することができますリアルタイムでモデルと対話するとき。
全体を通して、Topographicaは、利用可能なコンピューティングパワー、興味のある現象、および検証のために利用可能な生物学的データの量によって決定されるように、それは単純で、ディテールと複雑の適切なレベルを使用することを可能にします。
右上の図は、網膜の入力は視床、一次視覚野、より高い皮質領域によって形質転換する方法をモデル化し、視覚系における初期段階の例Topographicaモデルを示します。 Topographica汎用マップシミュレータであるため、それはまた、地形、タッチや聴覚などのマップ、だけでなく、運動の領域から構成されている任意の他の感覚モダリティをサポートしています。
Topographicaは、ダウンロードするために自由に利用可能であり、その機能任意のユーザーが拡張され、変更することができるオープンソースプロジェクトです。私たちは、ユーザーからの貢献を歓迎し、私たちのグローバル分散開発チームに参加したい人を招待。
コー​​ドは非常に活発に開発中であるが、それは非常に多くの研究プロジェクトや学術クラスで日常的に使用しています。
現在の開発の速いペースを考えると、開発者であることは、おそらくすべての変更についていくための最良の方法です。