Bibliosphere Analysis Kit

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Bibliosphere Analysis Kit
ソフトウェアの詳細:
バージョン: 5.11
日付のアップロード: 3 Jan 15
開発者: Genomatix Software
ライセンス: 無料
人気: 10

Rating: 3.0/5 (Total Votes: 1)

BiblioSphereは遺伝子調節および生物学的ネットワークに興味の分子生物学者のための文学マイニングおよび経路解析のユニークな組み合わせを提供しています。
 BiblioSphere経路Editionは、別の生物学的状況において生物学的ネットワークにあなたのデータをリンクできるように自動化された知識抽出のために、最新のテキストマイニング技術と一緒に遺伝子、タンパク質、複合体、細胞及び組織の間で個別にモデル化された関係の包括的なデータベースを使用しています。
 

  • に使用BiblioSphere標準経路情報(規制&代謝)
  • この超えた生物学的ネットワークを拡張し、生物学的な知識や配列ベースの分析
  • このを使用して、高スループットの結果をマージcontext-を行う感受性調節経路分析
  • この実験固有の経路を生成バリアント病気のメカニズム&遺伝子に
  • このリンク経路
  • この高度な実験デザインます
  • を行う
    5.11の新機能:
    さまざまな小さな機能強化とバグ修正

    このリリースのの新機能は次のとおりです。

    新機能と強化されたデータソース

    • Genomatixエキスパート注意深く集め遺伝子 - 遺伝子関係:
       GenomatixはBiblioSphereへの遺伝子調節の専門家キュレーションデータの独自の知識ベースを統合しました。このユニークなデータソースは、「遺伝子Aは、物理的に、遺伝子Bと相互作用」「遺伝子A、遺伝子Bの転写を活性化する」等の情報を提供する、動的に生成さBiblioSphere遺伝子ネットワークに遺伝子 - 遺伝子関係のセマンティクスを追加する。
    • このシグナル伝達経路:
       文献からコンパイルされたシグナル伝達に関連する遺伝子オントロジーの部分とデータを集中ネットワークに結合されたカノニカル経路の同定を可能にするために組み合わされている。
    • この代謝経路の関連付け:
       代謝経路の関連付けは、遺伝子のあなたのセットに関連する代謝事象の同定を可能にするために統合されている。
      専門家キュレーション遺伝子 - 遺伝子関係を持つ
    の新規または拡張ビュー
    • パスウェイの表示
       遺伝子群は、自動化された知識抽出から得られたデータを持つ手キュレーション遺伝子 - 遺伝子の関係を組み合わせた分かりやすい動的なネットワークグラフにコンパイルされます。ネットワークは、フィルタによってカスタマイズされた最短経路解析を実行する方法を中心とした遺伝子に焦点を合わせることができる。
    • この細胞内局在を見る
       GOアノテーションの遺伝子に基づいて細胞内位置に割り当てられ、図解セルレイアウトとして可視化は、細胞内領域を同定することを可能にして、遺伝子セットに関連するコンパートメント。
    その他の新機能
    • プロジェクト管理:プロジェクトフォルダにそれらを整理することで、あなたの分析を管理します。素早くマウスを数回クリックするだけで、以前の結果にアクセスするか、または既存のプロジェクトに新しい検索を追加します。

    5.11の新機能:
    • さまざまな小さな機能強化とバグ修正します。
    • の要件

      • Mac OSのインターネットへのX 10.2以上
      • このJavaの1.4.1(更新1を推奨します)
      • この接続
      • このGenomatix評価アカウント(無償)

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