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ソフトウェアの詳細:
codonPhyMLは系統発生の復興に進化のマルコフコドンモデルを使用しています。入力として、そのDNA配列によって特徴付け種のセットが指定されると、codonPhyMLは最高の彼らの進化的関係を記述し、系統樹を返します。これは、OpenMPを通じてNNIとSPRツリートポロジ探索ヒューリスティック、最尤によって推定置換速度パラメータ、およびマルチコアのサポートを備えています。
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