SAVI Signaling Analysis and Visualization

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SAVI Signaling Analysis and Visualization
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バージョン: 2.5
日付のアップロード: 23 Sep 15
ライセンス: 無料
人気: 54
サイズ: 20840 Kb

Rating: 3.0/5 (Total Votes: 2)

生体分子はノードとして表現さ​​れ、それらの相互作用は、リンクとして表されるグラフ(ネットワーク)のような

の表示、タンパク質 - タンパク質およびリガンド - タンパク質相互作用は、分子メカニズムの体系的な理解を達成するために、異なるソースからの実験結果を統合するための有望なアプローチであります細胞の表現型を駆動します。このようなネットワークの可視化が課題である一方で、大規模なシグナル伝達ネットワークの出現は、トポロジカル統計分析のための機会を提供します。 SAVIは、ネットワークモチーフのクラスタリング、接続分布と検出だけでなく、可視化を計算するために、標準的な方法を実装しています。さらに、SAVIは、テキスト形式でネットワークデータセットから完全なウェブサイトを生成します。 SAVIはPathwayGeneratorと呼ばれるツールが含まれています。このツールは、細胞シグナル伝達の相互作用を記述した大きなテーブルからWebページなどの接続マップを​​作成します。 SAVIはまた、遺伝子/タンパク質名のリストからネットワークを作成することができます。

バージョン2.5が指定されていない更新、拡張、またはバグ修正を含むことができます。

要件:ます。

Windowsの(すべて)

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