スイスPdbViewer(別名DeepView)は、同時にいくつかのタンパク質を分析することができるようにユーザーフレンドリーなインターフェースを提供するアプリケーションです。タンパク質は、構造アラインメントを推定し、それらの活性部位または他の任意の適切な部分を比較するために重ね合わせることができる。アミノ酸変異は、H結合、角度および原子間距離が直感的グラフィックとメニューインターフェースのおかげで入手が容易である。
スイスPdbViewer(別名DeepView)はニコラスGuexによって1994年から開発されています。スイスPdbViewerはしっかりとSWISS-MODEL、バーゼルのBiozentrumでの構造バイオインフォマティクスグループのバイオインフォマティクスのスイス研究所(SIB)内で開発、自動ホモロジーモデリングサーバにリンクされています。
これら二つのプログラムでの作業が大幅にそれが3Dテンプレートへのタンパク質の一次配列をスレッドとスレッドのタンパク質がどのくらいうまくの即時のフィードバックを得ることが可能であるように、モデルを生成するために必要な作業量を削減不足しているループを構築し、側鎖のパッキングを改良するための要求を提出する前に、参照構造によって受け入れ。
スイスPdbViewerも電子密度マップを読み、密度に構築するためのさまざまなツールを提供しています。加えて、様々なモデリングツールが統合され、人気のエネルギー最小化パッケージのコマンド·ファイルを生成することができる。
最後に、特別ボーナスとして、POV-Rayのシーンは見事なレイトレース品質の画像を作るために現在のビューから生成することができます。
の新機能であるの今回のリリースで:
- チミンC6原子が正しくロードされ
- このPC版のPOV-Rayの出力無限ループを修正
PC上で - このPDBファイルの保存中に(例えば2i37など)時折クラッシュが修正されました
- このウプサラ電子密度マップサーバのアドレスを更新します。
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