Arabidopsis Motif Scanner

ソフトウェアのスクリーンショット:
Arabidopsis Motif Scanner
ソフトウェアの詳細:
バージョン: 2.0
日付のアップロード: 2 Oct 16
開発者: IBBA-CNR
ライセンス: 無料
人気: 41
サイズ: 58026 Kb

Rating: 2.0/5 (Total Votes: 2)

シロイヌナズナモチーフスキャナ(AMS)は、ローカルコンピュータ上で実行するWindowsアプリケーションです。これは、モデル植物のシロイヌナズナのシス調節エレメントの位置を特定することにより、遺伝子の関係を評価し、評価するための簡単なインターフェイスを提供することにより、遺伝子ネットワークを構築するために開発されました。その主な革新的な機能は、転写因子によって調節される遺伝子ネットワークを識別するためのNGSとDNAチップアレイ発現データ、シロイヌナズナのアノテーションと遺伝子の相互作用、シス調節エレメントの位置を組み合わせることです。転写因子の機能に焦点を当てた研究では、ソフトウェアは、直接標的遺伝子を予測する調節性遺伝子領域における発現データと結合部位のモチーフを使用します。さらに、AMSは、対象の転写因子によって調節される代謝経路の同定を容易にするために、DNA、タンパク質およびタンパク質 - タンパク質相互作用データを利用します。

スクリーンショット

arabidopsis-motif-scanner_1_323191.png
arabidopsis-motif-scanner_2_323191.png
arabidopsis-motif-scanner_3_323191.png

サポートされるオペレーションシステム

同じようなソフトウェア

im2graph
im2graph

26 Jul 16

Slip21
Slip21

25 Aug 17

Spice-MLP
Spice-MLP

9 Aug 16

開発者の他のソフトウェア IBBA-CNR

Split & Join
Split & Join

11 Apr 18

Visual Blast
Visual Blast

11 Apr 18

へのコメント Arabidopsis Motif Scanner

コメントが見つかりません
コメントを追加
画像をオンにする!