Visual Blast

Visual Blast 1.4 更新

BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)は、クエリーに似た配列のライブラリーを検索する一般的なプログラムです。 BLASTの新規ユーザーが経験した主な問題は、構文的および意味的に正しいコマンドラインを構築し、入力ファイルを受け入れ可能なフォーマットにし、出力を評価することです。ここでは、BLAST検索を実行するためのGraphical User InterfaceをVisual...

Split&Joinは、多数のDNA、RNAまたはタンパク質配列を含むファイルをfasta、tabまたはfastq形式で分割して結合する必要がある生物学者向けのソフトウェアです。ユーザがシーケンスを分割したい場合、ファイルはドラッグ・アンド・ドロップ・ボックスにドロップすることによってロードされます。ファイルごとのシーケンスの数は、アップダウン番号ウィンドウのユーザーによって定義されます。分割ボタンをクリックすると、分割ファイルを含む新しいフォルダが作成されます。結合の場合、シーケンスファイルはドラッグアン...

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シロイヌナズナモチーフスキャナ(AMS)は、ローカルコンピュータ上で実行するWindowsアプリケーションです。これは、モデル植物のシロイヌナズナのシス調節エレメントの位置を特定することにより、遺伝子の関係を評価し、評価するための簡単なインターフェイスを提供することにより、遺伝子ネットワークを構築するために開発されました。その主な革新的な機能は、転写因子によって調節される遺伝子ネットワークを識別するためのNGSとDNAチップアレイ発現データ、シロイヌナズナのアノテーションと遺伝子の相互作用、シス調節エレメン...