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このクロマチックドットプロットは、一つのシーケンス内の高低の類似性の領域を識別し、表示するために使用される（例えば、リピートまたはタンデムリピートを散在）または2つの異なる配列間ことができる。カラーコードは、低品質の試合で飽和ため、パラメータの複数のテストと調整を必要とせずにされているドットプロットで対角線を識別することができます。
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