Ghemicalは、GNU GPLの下でリリース計算化学ソフトウェアパッケージです。これは、パッケージの完全なソースコードが利用可能であることを意味し、ユーザーがパッケージを研究し、自由に変更できます。 Ghemicalは、C ++で書かれています。
Ghemicalプロジェクトは(GNOMEに基づいています)のグラフィカル·ユーザー·インターフェースを持っており、それは量子力学(半経験的およびアブイニシオ)モデルと、分子力学モデルの両方をサポートしています(有機molecuための実験トライポス5.2のような力場もあります還元されたタンパク質のモデル[1]のためのツールが含まれている。構造最適化、分子動力学と可視化ツールの大きなセットは、現在利用可能です。
Ghemicalは量子力学的計算を提供するために、外部コードに依存しています。半経験的方法MNDO、ミンド/ 3、AM1とPM3はMOPAC7パッケージ(パブリックドメイン)から来て、ソース配布に含まれています。
MPQCパッケージ(GNU GPL)は法第一原理を提供するために使用される:ハートリー·フォック理論に基づく方法は、現在** STO-3Gから6-31Gの範囲の基底セットでサポートされています。
MPQCコードは、ソースディストリビューションに含まれていません。 Ghemicalのメソッド第一原理MPQCベースABを使用するには、まずコンパイルしてインストールし、システムのMPQCプログラムを、その後、一緒にプログラムをリンクするいくつかの特定の設定を使用してGhemicalをコンパイルする必要があります。詳細については、INSTALLファイルを参照してください。 Ghemicalもインポートおよびエクスポート多くの異なるファイル形式の(だけでなく、他のタスク)のためopenBabelなどのパッケージが含まれています。
インストール
あなたが最新リリースをダウンロードしたら、または同等に「;タールghemical-1.00.tar -xvvf gunzipをghemical-1.00.tgz "" ghemical-1.00.tgz -zxvvfタール」を使用して、アーカイブファイルからすべてのファイルを抽出する必要があります。その後あなただけの追加情報を取得するために抽出-file「INSTALL」をお読みください。
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