SEEDS

SEEDSは、確率論的生態と進化ダイナミクスシステムです。
拡張されたドキュメント：
文書化の主な供給源は、種子のウェブサイトです。ここでは、詳細なインストール手順は、ハウツーガイド、コードテンプレート、および例の実験が設けられています。
SEEDSのインストール：
SEEDSはhttp://networkx.lanl.gov/で利用可能NetworkXパッケージを必要とします。さらに、SEEDSは、Pythonのバージョン2.6.5以降が必要です。
SEEDSは、「Pythonのsetup.pyインストール」を実行して含まsetup.pyスクリプトを使用してインストールすることができます。
あなたは、種子がインストールされたディレクトリを指定した場合、あなたはそれがあなたのPython環境で検索であることを確認する必要があります。これは、あなたのPYTHONPATHにインストールされたディレクトリに配置することによって行うことができます。
SEEDSの実行：
箱から出して、SEEDSは、examplesディレクトリ内の簡単な実験が含まれています。 SEEDSがシステムにインストールされた後、これらの実験は、実行することができます。それを構成する方法を、実験について学ぶために、特定のディレクトリ内のREADME.txtファイルを参照し、それを実行する方法。
SEEDSの拡大：
種子は、プラグインベースのフレームワークとして設計されています。これは、あなたが作成し、独自の細胞タイプ、トポロジ、およびトポロジを使用し、ベースSEEDSフレームワークを変更することなく、すぐにこれらを使用することができます。
あなたに関心のあるモデルの動作実験を作成するには、セルタイプを作成する必要があります。このプロセスの詳細については、種子のウェブサイト上で見つけることができます。さらに、試料セルタイプは、examplesディレクトリで見つけることができます。
あなたは追加の型またはアクションを作成したら、それらを使用するための実験を​​指示する、「プラグイン」と呼ばれるディレクトリ、および編集seeds.cfgに配置します。細胞型については、「実験」の「セル」のパラメータの値を変更します。トポロジでは、「実験」セクションの「トポロジー」パラメータの値を変更します。アクションについては、「実験」のカンマ区切りの「アクション」パラメータに追加します。あなたのプラグインへのパラメータは、あなたのコード内で定義するセクションにseeds.cfgファイルで設定することができます。

要件：ます。

Pythonの