CWC Simulator

CWCシミュレータはCWC、生物学的システムの表現とシミュレーションのための計算のC ++実装です＆NBSP;インストールが正常に完了した後（INSTALLを参照してください）​​いくつかの例に示すように、CWCのモデル上でシミュレーションを実行することができます（/例を参照してください）​​。
（コマンドライン）インタフェース
一般的なユーザーとしては、実行する必要があります。

-i model.cwc
-o <統計>
-t <時間>
-s
-n <実行>
-c <クラスター>
--qt閾値<しきい値>
-q <分位>
-w <労働>
ここで、
- は実行可能ファイルの名前（デフォルト：scwc）;
＆NBSP; - model.cwc入力CWCプログラムが（例を参照）です。
＆NBSP; - 統計は、出力ファイルの接頭辞です。
＆NBSP; - <時間>は、シミュレーション時間の制限があります。
＆NBSP; - （時間制限= 30で250ポイントを取得する、すなわち0.12）のサンプリング周期です。
＆NBSP; - <実行>シミュレーションのインスタンスの数です。
＆NBSP; - <クラスター> K-手段のためのクラスタの数であります
＆NBSP; - は、QTクラスタリングのための閾値であります
＆NBSP; - <分位数>は、変位値の数です。
＆NBSP; - <労働>お使いのシステムのコア数と一致するように、通常は持っている（すなわち4クアッドコアCPUのため）。
出力
ツールが生成されます。
- いくつかの.datファイル（シミュレーションのサンプリングされた出力）
- いくつかのgnuplotのスクリプトは、統計analysisesを描きます
我々は、包括的なユーザーマニュアルで作業している

この特長：CWCモデル上の

このガレスピーSSAアルゴリズム
ハイブリッド確率的/決定論的意味論
オンライン統計とシミュレーションの複数のインスタンス
FastFlowの枠組みに基づいて、マルチコア·アーキテクチャの最適化
拡張可能な統計的フレームワーク（平均·分散し、濾過し、クラスタリングなど）
複数の評価のセマンティクス（質量作用、ミカエリス·メンテン、ヒルなど）