バイオインフォマティクスベンチマークシステムは、そのシステムの性能を調査するために、エンドユーザーやベンダーを有効にするために、合理的なテストフレームワーク、テスト、およびデータを構築しようとする試みです。私たちがやろうとしていることは、テストのためのフレームワーク、およびすべてのダウンロードおよびシステム性能の特定の要素をプローブするために使用することができるテストのコアセットを作成することです。また、これらのテストのソースはGPLの下で利用可能であり、アイデアを簡単に測定やチューニングの理由で意味のある...

高速遺伝的アルゴリズムは、一般的な遺伝的アルゴリズムのシンプルで強力な実装であり、​​そしてクロスオーバーと選択手順の多くの種類を提供します。このようなcombinatorical最適なものとして、数学的問題を解決するために、ならびに人工生命シミュレーションを構築するのに適しています。C...

SciGraphica

SciGraphica 2.1.1

SciGraphicaは、科学的データの可視化および分析アプリケーションです。これは、2Dと3Dのグラフの基本的な描画機能の多くを提供しています。これは、同じ時間とPS出力でで動作するように複数のワークシートやグラフを開いています。libscigraphicaライブラリはプログラムのカーネルであり、すべてのウィジェットやダイアログだけでなく、新たなプラグインシステムを提供します。ここで、「SciGraphica」のある主要な機能は次のとおりです。...

Staden Package

Staden Package 1.7.0 / 2.0.0 Beta 8

シュターデンパッケージは、UnixやLinux、MacOSXはとMS Windows用のDNA配列アセンブリ(Gap4)、編集および分析ツール(スピン)の十分に発達したセットです。Gap4面では、関連に参加するいくつかの小さながありましたどのようにスコアの改善はの内部ジョインとジョイン検索参加エディタに並ぶボタンの機能。またgap4への結果のは(io_libするための様々な変化でありますさまざまなトレース·ファイル·フォーマットへのすべてのI /...

AREM

AREM 1.0.1

AREMは(チップ、配列データのモデルベース分析)MACSに基づいています。クロマチン免疫沈殿(チップSEQ)に結合されたハイスループットシークエンシングが広くゲノムワイドな転写因子、補因子、クロマチン修飾剤、および他のDNA結合タンパク質の結合パターンを特徴付けるに使用されます。 ChIPの-、配列データ分析の重要なステップは、参照ゲノムに短いハイスループット配列決定から読み取るマップと短い読み取りで強化されたピーク領域を同定することです。いくつかの方法は、チップ -...

CLHep

CLHep 2.06.08

CLHEPは、ランダム発生器、物理学ベクトル、幾何学、および線形代数などのHEP固有の基盤とユーティリティクラスのセットであることを意図している。examplesディレクトリ内のファイルの中には、どのようにピューティアーでHepMCを使用する方法を示すことを目的としている。現在のところ、Pythia6.1にリンク。一部のプラットフォームでは、これがinitpydata()の呼び出しによって達成されている外部のようにピューティアーPYDATAブロックデータの初期化を必要とします。あなたがピューティアーの初期化...

GeoAlchemy

GeoAlchemy 0.7.2

GeoAlchem​​yはSQLAlchem​​yのを使用してORM層での地理空間データ型のサポートを提供するSQLAlchem​​yの拡張機能です。それは、オープン地理空間コンソーシアム(OGC)で指定された空間操作との関係をサポートすることを目指しています。インストール:のいつものようにタイプをインストールするには:easy_installをGeoAlchem​​yまたは、geoalchem​​y dirと型に変更し、パッケージをダウンロード:Pythonはsetup.py installを ...