このInDelFixer次世代配列決定データから、挿入または欠失を生じさせるフレームシフトを除去するためのJavaプログラムである。いくつかの場合においては、目的のタンパク質は、フレームシフトとのバリアントを有していないことが知られている。このフレームシフトは、所定の参照ゲノム(または将来のバージョンで複数の位置合わせ)を補正することができる。プログラムはFASTQファイルとしてファイル、FASTA /...

QuasiRecombは、ウイルス準種を生成するためのマルコフモデルをシミュレートし、コマンドコンソールで実行される軽量のアプリケーションです。これは、次世代の配列決定データを分析することによって、そのパラメータを推定する、ウイルス準種の生成及び方法を記載している。モデルは、明示的に考慮に再結合プロセスを取ることの利点を示す、シミュレートされたデータで検証、および実験HIVサンプルから得られた読み取りするため適用することによって試験される。それは、モデルパラメータと準種のウイルス株の分布を推定する方法の最大...

SASfit

SASfit 0.93.4

SASfitは、特別にあなたに小角散乱データへのフィッティング構造モデルのためのプログラムを提供するように設計、シンプル便利な、非常に使いやすいアプリケーションです。それは不変、とPorod定数散乱、回転半径のような一体型構造パラメータを計算することができます。異なる構造因子を含むいくつかのフォームファクタと共にサイズ分布に合うことができる。さらに、アルゴリズムは、同時に、パラメータの共通セットで複数の散乱曲線にフィットすることを可能にする、実施されている。グローバルフィットは単一の曲線を解析することにより...

SketchEl

SketchEl 1.56

このSketchElツールおよび分子スプレッドシートデータ入力アプリケーションをスケッチインタラクティブ化学分子である。分子スケッチが提供する機能セットは、便利な小分子構造のダイアグラム表現を編集するために必要な最低限の機能に大きく制限される。ツールバー、テンプレート、マウスジェスチャー、キーボードショートカット、ユーティリティコマンド、およびいくつかのビューモードは、できるだけこのように便利にするために提供されています。分子が容易にユビキタスMDL...

PoseView

PoseView 1.1.2

このPoseView生PDBファイルと構造データを提供することによって、2D図を生成することができるコンパクトな工具。入力は、結晶構造から直接か、またはドッキングプログラムなどによって計算される。出力は、GUIで可視化またはPNG-、PDF-、またはXFIGファイルにエクスポートすることができます。...

FlexNovo

FlexNovo 1.6.3

このFlexNovo増分活性部位にリガンドを構築するのFlexXテクノロジーに基づく新しい分子設計プログラムである。これは、標的の三次元構造との関連でデノボ設計を解除するフラグメントベースのアプローチを容易にする。これは、統合されたユーザーがカスタマイズアイデア生成系であることを意味する。これは、鉛のプロトタイプのライブラリーを設計し、標的タンパク質のための新規の足場、ならびに代替結合様式を提案において、新たな構造モチーフを示唆している。一方が起動した場合にも、活性部位の深さにおけるリガンドの進化を促進する...

MoSS

MoSS 6.10

モスは、分子の記述のデータベースに頻繁な分子の部分構造を発見するためのプログラムです。アルゴリズムは、頻出アイテム集合マイニングのためのエクラアルゴリズムに基づいています。別にデフォルトモス/外務省アルゴリズムから、このプログラムは、特殊な処理モードとしてgSpanアルゴリズムが含まれています。...