フリー バイオインフォマティクス のために Linux

Orthancは、軽量、シンプル、完全に無料、オープンソースであり、かつ強力なRESTfulな単体のDICOM（医療におけるデジタル画像と通信）医療と医学研究環境で使用できるサーバます。これは＆rsquo; SAコマンドラインソフトウェアは、C...

Jmolは、もともと3D化学構造の分子ビューアとして機能するように設計されたオープンソースのクロスプラットフォームでフリーなグラフィカルソフトウェアです。 HTML5...

Pathomx（旧MetaPath）は、GNU /...

Murkaは、ユーザーが簡単に単に中央ネットワークを使用することにより、系統の問題を解決するのに役立つ無料、クロスプラットフォーム、オープンソースのコマンドラインソフトウェアです。それは、ヒューリスティックな方法、正確なアルゴリズムと同様に、シュタイナー問題解決を含んでいます。Murka＆rsquo; sの入力は可逆とアライメントstepmatrix、および出力の提供（サブ）最適な木と、それらのいくつかの組み合わせを提供します。ソフトウェアは、LinuxおよびMicrosoft...

PathVisioはオープンソースであり、完全に無料グラフィカルアプリケーション、Javaプログラミング言語で実装されており、GNU / Linuxのオペレーティングの下で​​生物学的経路を表示する分析し、編集するために使用されるようにゼロから設計は、経路を描画するために使用することがsystem.Can...

Biotools社は、Pythonで書かれたバイオインフォマティクスのユーティリティの束である。 の要件の：ます。 ...

このMACS2は、ChIPの、配列データのためのモデルベースの​​分析ツールである。配列決定技術の向上に伴い、ハイスループットシークエンシング（チップ配列）に続いてクロマチン免疫沈降は、ゲノムワイドなタンパク質-DNA相互作用を研究するために人気を集めている。強力なChIP配列分析法の欠如に対処するために、我々は、結合部位の転写因子を同定するために、ChIPの-配列（MACS）のモデルベースの​​分析という新規なアルゴリズムを提示する。...

MISO（アイソフォームの混合物）の発現レベル＆NBSPを定量Pythonで書かれた確率的なフレームワークであり、RNA-配列データから選択的スプライシングされた遺伝子のうち、およびサンプルの間で示差的に調節アイソフォームまたはエクソンを識別します。RNA-配列におけるアイソフォームから生成される読み取ることで生成的なプロセスをモデル化することにより、MISOモデルは、読み込みが特定のアイソフォームに由来する確率を計算するためにベイズ推論を使用しています。MISOは、選択的mRNAアイソフォームの基本的なセ...

人間のゲノムおよびトランスクリプトーム内および特性照会し、拡張性の高い結果データベースと管理のためのユーザーフレンドリーなウェブベースのソフトウェア·アプリケーションと一緒に、カプシドは、包括的なオープンソースの病原体配列同定＆NBSP用の高性能計算のパイプラインを統合したプラットフォームですし、結果を可視化する。ののはじめにあなたは、Pythonの2.6+インストールおよびApache Tomcat 6+をMongoDBのデータベースが必要になります。詳細については、wikiを読んで： ...

Genepidginは、評価および割り当て遺伝子産物名を支援Pythonツールのスイートです＆NBSP、3つの主要コンポーネントがあります。：genepidgin *クリーナー*＆NBSP; UNIPROTの命名ガイドラインあたりの遺伝子名を標準化genepidgin *比較*とをタップ、遺伝子名の二つ以上のセットを比較するgenepidgin選択* *＆NBSP;相同性証拠のvareityから最も適切な製品名を選択し、現在の開発状況などの詳細については、Genepidginのマニュアルをご覧ください。 ...