InDelFixer 0.9
このInDelFixer次世代配列決定データから、挿入または欠失を生じさせるフレームシフトを除去するためのJavaプログラムである。いくつかの場合においては、目的のタンパク質は、フレームシフトとのバリアントを有していないことが知られている。このフレームシフトは、所定の参照ゲノム（または将来のバージョンで複数の位置合わせ）を補正することができる。プログラムはFASTQファイルとしてファイル、FASTA /...
QuasiRecomb 1.0
QuasiRecombは、ウイルス準種を生成するためのマルコフモデルをシミュレートし、コマンドコンソールで実行される軽量のアプリケーションです。これは、次世代の配列決定データを分析することによって、そのパラメータを推定する、ウイルス準種の生成及び方法を記載している。モデルは、明示的に考慮に再結合プロセスを取ることの利点を示す、シミュレートされたデータで検証、および実験HIVサンプルから得られた読み取りするため適用することによって試験される。それは、モデルパラメータと準種のウイルス株の分布を推定する方法の最大...
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InDelFixer 22 Jan 15
QuasiRecomb 22 Jan 15