E-Cell System

E-電池システムは、コンピュータ上の仮想セルを構成する概念です。
E-電池システムは、浩一、高橋によって設計および開発者の素晴らしいチームによって書かれた、このような生体細胞のような大規模複雑なシステムのモデリング、シミュレーション、および分析のためのオブジェクト指向のソフトウェアスイートです。システムのコア部分、E-細胞シミュレーション環境のバージョン3は、多くのコンポーネントが共存するために、異なる時間スケールで複数のアルゴリズムによって駆動できます。
E-細胞プロジェクトは、正確な細胞全体のシミュレーションを可能にするために必要な理論的な支持、技術およびソフトウェアプラットフォームの開発を目指した国際的な研究プロジェクトです。
E-電池システムは、以下の3つの主要な部分で構成されます。
- E-細胞シミュレーション環境（またはE-セルSE）
- E-セルモデリング環境（またはMEをE-CELL）
- E-細胞解析ツールキット

この特長：

この基本的な機能：
複雑なシステムのオブジェクト指向モデリングとシミュレーション。
プラグインアーキテクチャ。新しいユーザ·オブジェクト·クラスは、開発動的にロードされ、シミュレーションに使用することができます。
シミュレーション中にリアルタイムのユーザー操作と可視化。
スクリプト：
シミュレーションセッションのPythonスクリプト（などの処理を実行/停止/パラメータ操作/データ...）。
シミュレーションセッションの多くのラン伴うシミュレーション実験のPythonスクリプト（例えば、パラメータチューニング、代謝制御解析などのように..）
モデルファイルの生成のPythonスクリプト（データベースから自動モデル構築用など）。
互換性：
SBMLレベル1/2インポート。
SBMLレベル1/2輸出。
並列計算：
単一のシミュレーション·セッションの共有メモリ、マルチスレッド並列化。 （メインブランチにマージすることができます。）
クラスタとグリッドは、複数のシミュレーション·セッションの計算を配布しました。 Sun Grid Engineの、（Globusのツールキット）。

このリリースで新しい何が：

このバージョンでは、さまざまなバグ修正が追加されます。

この何がバージョン3.1.107 RC2で追加されます。

（）ecell.Session.saveLoggerDataの不具合を修正しました。 （森吉）
ecell.ECDDataFileの不具合を修正しました。 （森吉）

このバージョン3.1.107 RC1の新機能である：新しいGCCでます。

固定コンパイルの問題（＆GT; = 4.3）。 （森吉）
pyecellに統合pye​​cs。 （森吉）
（Mac OS Xを含む）では、いくつかのプラットフォームでは、静的初期化子のすごみを回避するためにecell.ecsにecell.emcを吸収合併。 （森吉）
二つのGUIフロントエンド（セッション·モニターとモデルエディタが）Pythonモジュールの二つのパッケージ、ecell.ui.osogoとecell.ui.model_editorものに更新しました。 （森吉）
ECELL /フロントエンド/ SESSION_MANAGERに存在ecell.ui.osogo.GtkSessionMonitorに移動GtkSessionMonitor。 （森吉）
ecell.session_managerにecell.SessionManagerの名前を変更しました。 （森吉）
ecell.ecs_constantsから以下の定数を削除しました。 （森吉）