新しい バイオインフォマティクス のために Linux

のGeant4プロジェクトが問題を通して粒子の通過のシミュレーションのためのツールキットです。その応用分野は、高エネルギー物理学と核実験、医療、加速器や宇宙物理学の研究を含める のこのリリースではの新機能：ます。 ベルティーニカスケードを使用してガンマ核相互作用の新モデルが追加されました。安静時の核の捕獲のための PI-、K-用ベルティーニモデル、およびシグマは、電子の+の多重散乱のためWentzelVIモデルとし、HEPアプリ​​ケーションのためのすべての物理学リストの100...

STEMEプロジェクトは、MEMEなどをモチーフにしたファインダで使用されるモデルのタイプへの期待 - Maximisationアルゴリズムへの近似としての生活を始めた。STEME＆rsquoの; S EM近似は一桁より早くより典型的なパラメータ設定のためのMEMEの実装を実行します。 STEMEは現在、それ自体で本格的なモチーフのファインダーへと発展しています。のSTEMEを使うのはなぜ？の実績のあるモチーフ発見技術STEMEがテスト実証済みのMEMEアルゴリズムに基づいています。...

Genepidginは、評価および割り当て遺伝子産物名を支援Pythonツールのスイートです＆NBSP、3つの主要コンポーネントがあります。：genepidgin *クリーナー*＆NBSP; UNIPROTの命名ガイドラインあたりの遺伝子名を標準化genepidgin *比較*とをタップ、遺伝子名の二つ以上のセットを比較するgenepidgin選択* *＆NBSP;相同性証拠のvareityから最も適切な製品名を選択し、現在の開発状況などの詳細については、Genepidginのマニュアルをご覧ください。 ...

人間のゲノムおよびトランスクリプトーム内および特性照会し、拡張性の高い結果データベースと管理のためのユーザーフレンドリーなウェブベースのソフトウェア·アプリケーションと一緒に、カプシドは、包括的なオープンソースの病原体配列同定＆NBSP用の高性能計算のパイプラインを統合したプラットフォームですし、結果を可視化する。ののはじめにあなたは、Pythonの2.6+インストールおよびApache Tomcat 6+をMongoDBのデータベースが必要になります。詳細については、wikiを読んで： ...

MISO（アイソフォームの混合物）の発現レベル＆NBSPを定量Pythonで書かれた確率的なフレームワークであり、RNA-配列データから選択的スプライシングされた遺伝子のうち、およびサンプルの間で示差的に調節アイソフォームまたはエクソンを識別します。RNA-配列におけるアイソフォームから生成される読み取ることで生成的なプロセスをモデル化することにより、MISOモデルは、読み込みが特定のアイソフォームに由来する確率を計算するためにベイズ推論を使用しています。MISOは、選択的mRNAアイソフォームの基本的なセ...

このMACS2は、ChIPの、配列データのためのモデルベースの​​分析ツールである。配列決定技術の向上に伴い、ハイスループットシークエンシング（チップ配列）に続いてクロマチン免疫沈降は、ゲノムワイドなタンパク質-DNA相互作用を研究するために人気を集めている。強力なChIP配列分析法の欠如に対処するために、我々は、結合部位の転写因子を同定するために、ChIPの-配列（MACS）のモデルベースの​​分析という新規なアルゴリズムを提示する。...

Biotools社は、Pythonで書かれたバイオインフォマティクスのユーティリティの束である。 の要件の：ます。 ...

PathVisioはオープンソースであり、完全に無料グラフィカルアプリケーション、Javaプログラミング言語で実装されており、GNU / Linuxのオペレーティングの下で​​生物学的経路を表示する分析し、編集するために使用されるようにゼロから設計は、経路を描画するために使用することがsystem.Can...

Pathomx（旧MetaPath）は、GNU /...