PathVisio

PathVisioはオープンソースであり、完全に無料グラフィカルアプリケーション、Javaプログラミング言語で実装されており、GNU / Linuxのオペレーティングの下で​​生物学的経路を表示する分析し、編集するために使用されるようにゼロから設計は、経路を描画するために使用することがsystem.Can 、生物entitiesTheソフトウェアは経路を描画するためにユーザーができるようにリンク生物学データに生物学的物質（タンパク質または遺伝子）リンク、データベース識別子、編集経路を使用して、同様の経路を分析する。 PathVisioを使用すると、またそのようなマイクロアレイデータとして実験データをマップし、既存の経路の描画の上に可視化することができるようになります。
また、あなたは、遺伝子データベースを選択し、代謝データベースを選択することができます、統計、輸入発現データ、選択式データセット、検索経路、ビューの凡例を表示するには、オブジェクト、輸入プロジェクトを操作するだけでなく、インストールやプラグインを管理するために、これ全くinstallationTheアプリケーションがあなたのGNU / Linuxオペレーティングシステム上でそれをインストールすることなく使用することができないapp.Requiresに追加機能を追加することができます。あなたがしなければならないすべては、Softowareからバイナリパッケージをダウンロードし、お好みの場所にアーカイブを保存、アーカイブマネージャユーティリティを使用して、それを抽出し、抽出されたディレクトリを開くことです、とhoodWhile file.Under pathvisio.jarをダブルクリックしますPathVisioソフトウェアのボンネットの下に簡単に見を取って、私たちは＆rsquoのは、アプリケーションがJavaプログラミング言語で書かれていること、およびそのグラフィカル·ユーザ·インタフェースは、最新のJava Swingのテクノロジーで設計されていることに気づいたVE。我々＆rsquoのは、成功したJavaは、Javaプログラミング言語で書かれたsupportedBeingされている任意のOS上で32または64ビットCPU architectures.Runsのいずれかをサポートしているコンピュータ上でアプリケーションをテストしたVE、PathVisioは、GNU / Linuxをサポートするプラットフォームに依存しないアプリケーションを宣言することができますマイクロソフトは、Windows、Mac OS X、BSD、Solaris、および最新のJavaテクノロジがサポートされている他のオペレーティングシステム

のこのリリースではの新機能：ます。

• 2014年1月31日：バグ修正リリースします。
• GeneOntology用語が今の注釈の検索結果から削除されます。
• データノードは、IDおよびデータソースまたは何もで注釈される必要がある（唯一のIDやデータソースとのデータノードを保存すると、もはや許されません）

HTTP：固定ファイルのインポートモジュールの主なバグ

のバージョン3.1.2での新機能です。 //developers.pathvisio.org/ticket/1697ます。

のバージョン2.0.11のの新機能：

• 自動保存します。

スクロールホイールを使用して、
• ズームします。
• 行の選択が容易になりません：もはや必要では正確なピクセルをクリックします。
• 今過剰表現の分析のための2つのメソッドを持つ。 1つの経路指向と1つのデータ指向ます。

のどのバージョン2.0.10のの新しいです：図面の

• 新しい方法の効果をストレッチ避けるために、長方形を丸め
• さまざまな小さなバグ修正します。

のバージョン2.0.9の新機能のは何ですか。

• 任意の長さと任意のコネクタのための新しいコネクタタイプ角度ます。
• ニューQUOT、細胞成分＆QUOT。コンパートメントの生物学的意味を格納するためのプロパティ
• ニューQUOT;ダブル＆QUOT。ラインタイプ（ダブルmembraned小器官のために特に有用）

経路の
• クリッカブルハイパーリンクします。
• マイルストーン以下を参照してください。milestone_27＆QUOT＆QUOTを。バグ修正の完全なリストについては、

のバージョン2.0.8の新機能のは何ですか。

• の細胞成分の改善形状ます。

そのようなポップアップメニューでコピー/貼り付けます。として
• 少数のユーザビリティの向上
• マイルストーン以下を参照してください。milestone_26＆QUOT＆QUOTを。バグ修正の完全なリストについては、

のバージョン2.0.7でのの新機能：それは簡単にするために、

• ツールバーアイコンと新しいサイドパネル矢印の種類と形状（感謝liubing）します。
を選択し、
あなたが1つの経路から別のリンクを追加できるように、
• 経路データベースは
、データソースとして含まれている
• BioPAXコンバータが向上し、より有効なBioPAX文書を生成されています。
• 個々の点を操作することができる新しいコネクタタイプ（感謝leonth）
• データソースの数は180以上の
に増加されました
• マイルストーン以下を参照してください。milestone_25＆QUOT＆QUOTを。バグ修正の完全なリストについては、

の の新機能バージョン2.0.6に：

• 形状上のアンカーの数を増加させることができるデフォルトから12ます。
• はデータの可視化の伝説は今経路イメージ自体に表示することができます。以前は、サイドパネルにのみ表示されていたします。
• マイルストーン以下を参照してください。milestone_24＆QUOT＆QUOTを。バグ修正の完全なリストについては、

の何が新しいのバージョン2.0.4において：図形、ラベルとデータノードの

• 改善されたテキストの書式

データノードのための
• より多くの形状がします。
• シンプルなピクセル座標ます。
• データノード上に設定した背景色

のあるどのバージョン2.0.3のの新しい：

• このリリースで最も注目すべき新しいXMLスキーマがあるGPML経路形式（バージョン2010A）のために。この新しい経路フォーマットは、多くの新しいグラフィカル機能未来を有効に、あなたは次のリリースで登場するものの一部を楽しみにすることができます。
• その他の新機能：
• 、少なくとも何かが彼らに本当に目に見えない接続されている目に見えないアンカー（マーゴットのおかげで）
• エクストラ-vコマンドラインオプション（マークのおかげで）
• 現在選択されたデータベースは、
再びステータスバーに正しく表示されます
プラグイン開発者のための
• 多くの新しい拡張ポイント
• マイルストーン以下を参照してください。milestone_21＆QUOT＆QUOTを。バグ修正の完全なリストについては、

の何が新しいのバージョン2.0.1で：アンカーを指す自動コネクタの

• の改良アルゴリズムます。
• ショート＆QUOTを持って矢印型の改良された図面、ギャップ＆QUOT。終わりにします。
• Thawte社のフリーメールサービスがキャンセルされたので、我々は更新され私達のセキュリティ証明します。
• パスウェイ履歴ビューアはそれがなかったとしても、それぞれの行が変更と考えられていたバグがありました。これは修正されています。

の要件の

• オラクルのJava Standard Editionのランタイム環境ます。