新しい バイオインフォマティクス のために Linux

NetAtlas細胞シグナル伝達ネットワークをフィルタリングするために、組織の遺伝子発現データを使用してCytoscapeのプラグインです。...

MacMolPltは3-D分子構造と通常モード（振動）をプロットするための現代のグラフィックプログラムです。現代の手段：...

CodonWは、コドンとアミノ酸の使用量の多変量解析（コレスポンデンス分析）を簡素化するために設計されたプログラムです。また、コドン使用の標準指標を計算します。これは、メニューやコマンドライン·インタフェースの両方を備えています。CodonWプロジェクトはポールシャープ、遺伝学部、ノッティンガム大学の研究室でジョン·ピーデンによって書かれました。ジョンは人類遺伝学で働いており、現在はオックスフォード大学でWTCHGでProCardisデータベース·マネージャーとして採用されています。ここで、「CodonW」...

関数lsimは、巨大分子の電子密度を重畳し、構造的な類似性スコアを計算します。その計算は、比較される分子のサイズに伴って直線的に拡張します。関数lsimアラインメントは、生化学的、構造要素と概念的に無関係であり、したがって、構造のみのタンパク質の類似研究のために、公正かつ適切です。インストール：配布ファイルを解凍します。タール-xzvf関数lsim-linux.tar.gzファイルのディレクトリに移動します。CDのlsim.1.0.0コピー、移動、またはリンクする実行可能ファイルの関数lsimを適切な場所に...

CLCシーケンスビューアは、基本的なバイオインフォマティクスを作るためにユーザを可能にするソフトウェア環境を分析し、円滑なデータ管理、優れたグラフィカルな表示と出力オプションと組み合わせる作成します。ここで、「CLC無料ワークベンチ」のある主要な機能は次のとおりです。 - GenBankの検索と閲覧（線形と円形のビュー） - DNA、RNAおよびタンパク質（2アラインメントアルゴリズム）のマルチプルアライメント - オープンリーディングフレームの決意 - ...

CLC DNA Workbenchは、高度なDNA配列を大量に作成するユーザーを有効にするソフトウェア環境を作成し解析し、円滑なデータ管理、優れたグラフィカルな表示と出力オプションと組み合わせます。CLC DNA WorkbenchはWindows、Mac OS X、およびLinuxプラットフォームで使用可能です この特長：ます。...

MetagenomeDBを簡単メタゲノム配列を格納、取得、および注釈付けするように設計されたPythonのライブラリです＆NBSP;のMongoDBデータベースの上に抽象化レイヤとしてMetagenomeDB作用します。これは、2つのタイプのオブジェクト、すなわち配列やコレクションを作成および変更して接続するためのAPIを提供します。＆NBSP; *シーケンス（順序クラス）とすることができる読み込み、コンティグ、PCRクローンなど＆NBSP;...

シュターデンパッケージは、UnixやLinux、MacOSXはとMS Windows用のDNA配列アセンブリ（Gap4）、編集および分析ツール（スピン）の十分に発達したセットです。Gap4面では、関連に参加するいくつかの小さながありましたどのようにスコアの改善はの内部ジョインとジョイン検索参加エディタに並ぶボタンの機能。またgap4への結果のは（io_libするための様々な変化でありますさまざまなトレース·ファイル·フォーマットへのすべてのI /...

ProteinShopは、タンパク質の構造を操作するための対話型ツールです。それはすぐに人間の知識と直感を用いてタンパク質構成のセットを作成するために設計されました。これらの構成は、ローカルまたはグローバルな最適化を行うことができます。...

バインPythonで書かれたバイオインフォマティクスのためのミニチュアLIMSとワークフローマネージャである この要件：ます。 ...