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MISO（アイソフォームの混合物）の発現レベル＆NBSPを定量Pythonで書かれた確率的なフレームワークであり、RNA-配列データから選択的スプライシングされた遺伝子のうち、およびサンプルの間で示差的に調節アイソフォームまたはエクソンを識別します。RNA-配列におけるアイソフォームから生成される読み取ることで生成的なプロセスをモデル化することにより、MISOモデルは、読み込みが特定のアイソフォームに由来する確率を計算するためにベイズ推論を使用しています。MISOは、選択的mRNAアイソフォームの基本的なセ...

人間のゲノムおよびトランスクリプトーム内および特性照会し、拡張性の高い結果データベースと管理のためのユーザーフレンドリーなウェブベースのソフトウェア·アプリケーションと一緒に、カプシドは、包括的なオープンソースの病原体配列同定＆NBSP用の高性能計算のパイプラインを統合したプラットフォームですし、結果を可視化する。ののはじめにあなたは、Pythonの2.6+インストールおよびApache Tomcat 6+をMongoDBのデータベースが必要になります。詳細については、wikiを読んで： ...

ESMF（地球システムモデリングフレームワーク）は、使いやすさ、性能の移植性、相互運用性、および再利用気候で、数値予報、データ同化を高めるために、高性能、柔軟なソフトウェア·インフラストラクチャを構築するためのプログラムであり、ESMFはアーキテクチャを定義複雑な、結合されたモデリングシステムを構成するためのデータ構造および個々のモデルを開発するためのユーティリティを含む。ESMFの背後にある基本的な考え方は、複雑なアプリケーションでは、小さな断片、またはコンポーネントに分割する必要があるということです。コ...

Genepidginは、評価および割り当て遺伝子産物名を支援Pythonツールのスイートです＆NBSP、3つの主要コンポーネントがあります。：genepidgin *クリーナー*＆NBSP; UNIPROTの命名ガイドラインあたりの遺伝子名を標準化genepidgin *比較*とをタップ、遺伝子名の二つ以上のセットを比較するgenepidgin選択* *＆NBSP;相同性証拠のvareityから最も適切な製品名を選択し、現在の開発状況などの詳細については、Genepidginのマニュアルをご覧ください。 ...

STEMEプロジェクトは、MEMEなどをモチーフにしたファインダで使用されるモデルのタイプへの期待 - Maximisationアルゴリズムへの近似としての生活を始めた。STEME＆rsquoの; S EM近似は一桁より早くより典型的なパラメータ設定のためのMEMEの実装を実行します。 STEMEは現在、それ自体で本格的なモチーフのファインダーへと発展しています。のSTEMEを使うのはなぜ？の実績のあるモチーフ発見技術STEMEがテスト実証済みのMEMEアルゴリズムに基づいています。...

のGeant4プロジェクトが問題を通して粒子の通過のシミュレーションのためのツールキットです。その応用分野は、高エネルギー物理学と核実験、医療、加速器や宇宙物理学の研究を含める のこのリリースではの新機能：ます。 ベルティーニカスケードを使用してガンマ核相互作用の新モデルが追加されました。安静時の核の捕獲のための PI-、K-用ベルティーニモデル、およびシグマは、電子の+の多重散乱のためWentzelVIモデルとし、HEPアプリ​​ケーションのためのすべての物理学リストの100...

makeに似たシステムを構築し、頻繁に例えば複雑なワークフローを作成するために使用されているバイオインフォマティクスにおける＆NBSP; snakemakeは一緒に、高速で快適な実行環境で、Pythonのスタイルで清潔でモダンドメイン固有の仕様言語（DSL）を提供することで、ワークフローを作成するの複雑さを軽減することを目指しています。インストールの - ...

GPdotNETは、さまざまなエンジニアリングの問題のモデル化と最適化に遺伝的プログラミングと遺伝的アルゴリズムを適用するための人工知能ツールです。これは、WindowsとLinux...

reciprocal_smallest_distanceは、グローバル配列アラインメントと配列間の最大尤進化距離を正確にゲノム間の相同分子種を検出するために使用してペアワイズオルソロジーアルゴリズムです。のtarアーカイブからのインストールのダウンロードして、githubのから最新バージョンを解凍します：CD〜カール-L...

NetworkXは力学、構造、および複雑なネットワークの機能の作成、操作、および研究のためのPythonパッケージである の特長の：ます。 を許可するため1M +ノード、10M +エッジます。は、標準的なグラフ理論と統計物理学の機能が含まれています。アプリケーション、専門分野、およびプラットフォーム間のネットワークのアルゴリズムを簡単に交換します。多くの古典的なグラフや合成ネットワークます。を含みますノードとエッジがあること＆QUOTことができます。何でも＆QUOT。...