フリー バイオインフォマティクス のために Linux

このシールは、Hadoopの上の配列アラインメントを提供するPythonモジュールである。シールは、生物学的な配列アラインメントのためのMapReduceのアプリケーションです。 Pydoop（http://pydoop.sourceforge.net）、HadoopのためのPythonのMapReduceとHDFS APIを介してのHadoop（http://hadoop.apache.org）上でそれを実行ます。 の要件の ...

TRMinerは、科学的データの学芸員を目指すPythonのユーティリティです＆NBSP;それは急速に与えられた鉱山の目標に関連する文章に科学出版物の大規模なコレクションを剪定することができます。これは2つのステップで達成される。まず、テキストは、関連する言葉のトークンのシーケンスにtranlatedされている。第二に、正規表現パターンは、トークン配列において検索される。...

Pysamは読書とSamfilesを操作するためのPythonモジュールは＆NBSP;それはsamtools C-APIの軽量ラッパーです。クイックスタートガイドはこちらです。より詳細なドキュメントは、こちらをご覧ください。質問やコメントは大歓迎ですとhttp://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhatでpysamユーザーグループに送信する必要があります。このリリースで： samtools 0.1.8とTABIXサポートします。 の要件の ...

PySCeS分子細胞生理学＆NBSPトリプル-Jグループによって開発されたプロジェクトであり、順番にモデルを試してみて、生きた細胞を構成する複雑なプロセスとシステムを理解するために、 の特長の ...

ハゼは、バイナリデータファイルを読み取るためのPython...

SSuMMoは分類群にシーケンスを割り当てるためにHMMERを使用して反復的に周りに設計された関数のライブラリです＆NBSP;結果は、非常にそのコミュニティ内の種/属の分布を示す木をアノテートされています。ソースコードに含まれているプログラムは、ツールへのものがあります - - 隠れマルコフモデルの階層型データベース構築 - dictify.pyを。 - 分類学上の名前を認識するようにシーケンスを割り当てる - SSUMMO.pyを。 - シンプソン、シャノン＆その他methods-...

バローズ -...

PEATは、キャプチャ予測し、タンパク質の生物物理学的特性を分析するためのプログラムのスイートです。。の の要件ドキュメンテーション、手順、スクリーンショットなどのためhttp://enzyme.ucd.ie/PEATを参照してください： ...

このOpenElectrophy、操作、貯蔵および電気生理学的データの分析を容易にするフレームワークである。それは多くの異なるファイル形式からデータをインポートし、単一のSQL型データベースに格納することができます。分析ツールは、OpenELectrophyに含ま発振検出とスパイク検出である。さらなる分析は、書き込む必要があるがOpenElectrophyは非常にデータベースとその操作において有用なデータの照会を容易にし、クラスや関数のライブラリを提供します。スクリプトの例の完全なリストが提供されており、単...

NEO（神経アンサンブルオブジェクト）と一緒に、より近い同様の目標でOpenElectrophy、NeuroTools、多分他のプロジェクトを得ることを目的に、神経データ分析に使用する基底クラスの共通セットを提供するためのプロジェクトです。二つの主要な目的は、これまでに定義されています。とをタップ; *最初のマイルストーンは、電気生理学的（in vivoおよび/またはシミュレートされた）データを扱うための一般的なクラス名および概念を定義することである。＆NBSP;...