トップ バイオインフォマティクス のために Linux

HTSeqは、ハイスループットシークエンシング（HTS）アッセイからのデータを処理し、分析するためのPythonのフレームワークです。 の要件の：ます。 <...

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edittagは、編集メトリック配列タグのセットを設計する編集メトリックにフォメーションのための配列タグをチェックして、プラットフォーム固有のシークエンシングアダプターとPCRプライマーに配列タグを統合するためのアプリケーションのコレクションです。 edittagは他のアプローチとは異なります。＆NBSP; * edittagはマルチプロセッシングを使用して、合理的な時間枠で編集メトリック配列タグの任意の長さを生成し、とをタップ; *...

VULCANプロジェクトは、計算流体力学解析を提供します。VULCAN（複雑なフロー分析のための粘性風上アルゴリズム）は、シリアルおよびパラレル計算のさまざまなプラットフォーム上のフローを反応させ、非反応極超音速乱を通して亜音速のための計算流体力学を提供しています。推進フロー分析の計算コストは​​、楕円空間マーチングスキームのための特別な乱壁トリートメント、マルチグリッド法を使用することにより低減され、支配方程式のコンディショニングは、数値の剛性を低減させる。物理モデリング機能は、圧縮率、レイノルズ応力の異...

seriesoftubesのSolexaチップ-seqのデータの拡張パイプラインである。パッケージのドキュメント ...

reciprocal_smallest_distanceは、グローバル配列アラインメントと配列間の最大尤進化距離を正確にゲノム間の相同分子種を検出するために使用してペアワイズオルソロジーアルゴリズムです。のtarアーカイブからのインストールのダウンロードして、githubのから最新バージョンを解凍します：CD〜カール-L...

makeに似たシステムを構築し、頻繁に例えば複雑なワークフローを作成するために使用されているバイオインフォマティクスにおける＆NBSP; snakemakeは一緒に、高速で快適な実行環境で、Pythonのスタイルで清潔でモダンドメイン固有の仕様言語（DSL）を提供することで、ワークフローを作成するの複雑さを軽減することを目指しています。インストールの - ...

のGeant4プロジェクトが問題を通して粒子の通過のシミュレーションのためのツールキットです。その応用分野は、高エネルギー物理学と核実験、医療、加速器や宇宙物理学の研究を含める のこのリリースではの新機能：ます。 ベルティーニカスケードを使用してガンマ核相互作用の新モデルが追加されました。安静時の核の捕獲のための PI-、K-用ベルティーニモデル、およびシグマは、電子の+の多重散乱のためWentzelVIモデルとし、HEPアプリ​​ケーションのためのすべての物理学リストの100...

STEMEプロジェクトは、MEMEなどをモチーフにしたファインダで使用されるモデルのタイプへの期待 - Maximisationアルゴリズムへの近似としての生活を始めた。STEME＆rsquoの; S EM近似は一桁より早くより典型的なパラメータ設定のためのMEMEの実装を実行します。 STEMEは現在、それ自体で本格的なモチーフのファインダーへと発展しています。のSTEMEを使うのはなぜ？の実績のあるモチーフ発見技術STEMEがテスト実証済みのMEMEアルゴリズムに基づいています。...

Genepidginは、評価および割り当て遺伝子産物名を支援Pythonツールのスイートです＆NBSP、3つの主要コンポーネントがあります。：genepidgin *クリーナー*＆NBSP; UNIPROTの命名ガイドラインあたりの遺伝子名を標準化genepidgin *比較*とをタップ、遺伝子名の二つ以上のセットを比較するgenepidgin選択* *＆NBSP;相同性証拠のvareityから最も適切な製品名を選択し、現在の開発状況などの詳細については、Genepidginのマニュアルをご覧ください。 ...