ベスト バイオインフォマティクス のために Linux

のGeant4プロジェクトが問題を通して粒子の通過のシミュレーションのためのツールキットです。その応用分野は、高エネルギー物理学と核実験、医療、加速器や宇宙物理学の研究を含める のこのリリースではの新機能：ます。 ベルティーニカスケードを使用してガンマ核相互作用の新モデルが追加されました。安静時の核の捕獲のための PI-、K-用ベルティーニモデル、およびシグマは、電子の+の多重散乱のためWentzelVIモデルとし、HEPアプリ​​ケーションのためのすべての物理学リストの100...

pyNetConvは、一部のネットワーク·ファイル·フォーマットの変換を支援するために作成したPythonライブラリです。バージョン0.6以来、pyNetConvは、次のファイル形式を読み書き（およびから/への変換）することが可能です。...

Jmolは、もともと3D化学構造の分子ビューアとして機能するように設計されたオープンソースのクロスプラットフォームでフリーなグラフィカルソフトウェアです。 HTML5...

GDISは、単離された分子と周期系の表示や操作のためのGTKベースのプログラムです。このソフトウェアは開発中ですが、それでも非常に機能的です。ここで、「GDIS」のある主要な機能は次のとおりです。...

CLCシーケンスビューアは、基本的なバイオインフォマティクスを作るためにユーザを可能にするソフトウェア環境を分析し、円滑なデータ管理、優れたグラフィカルな表示と出力オプションと組み合わせる作成します。ここで、「CLC無料ワークベンチ」のある主要な機能は次のとおりです。 - GenBankの検索と閲覧（線形と円形のビュー） - DNA、RNAおよびタンパク質（2アラインメントアルゴリズム）のマルチプルアライメント - オープンリーディングフレームの決意 - ...

PathVisioはオープンソースであり、完全に無料グラフィカルアプリケーション、Javaプログラミング言語で実装されており、GNU / Linuxのオペレーティングの下で​​生物学的経路を表示する分析し、編集するために使用されるようにゼロから設計は、経路を描画するために使用することがsystem.Can...

Pysamは読書とSamfilesを操作するためのPythonモジュールは＆NBSP;それはsamtools C-APIの軽量ラッパーです。クイックスタートガイドはこちらです。より詳細なドキュメントは、こちらをご覧ください。質問やコメントは大歓迎ですとhttp://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhatでpysamユーザーグループに送信する必要があります。このリリースで： samtools 0.1.8とTABIXサポートします。 の要件の ...

CodonWは、コドンとアミノ酸の使用量の多変量解析（コレスポンデンス分析）を簡素化するために設計されたプログラムです。また、コドン使用の標準指標を計算します。これは、メニューやコマンドライン·インタフェースの両方を備えています。CodonWプロジェクトはポールシャープ、遺伝学部、ノッティンガム大学の研究室でジョン·ピーデンによって書かれました。ジョンは人類遺伝学で働いており、現在はオックスフォード大学でWTCHGでProCardisデータベース·マネージャーとして採用されています。ここで、「CodonW」...

AHREAは簡単に学習者相対的な発現を見つけることができsofwareスイートです。これは、Pythonで書かれてます。 要件：ます。 ...

mpiBLASTは、NCBI BLASTのMPIベースの並列実装です。プロジェクトはのformatdbを交換し、インストールMPIとコンピュータのクラスタ上で並列にBLASTのジョブを実行バージョンでblastallがプログラムのペアで構成されます。伝統的なBLAST対mpiBLASTを使用するには、主に2つの利点があります。まず、mpiBLASTは、クラスタ内の各ノード全体でデータベースを分割します。データベースの各ノードのセグメントは小さいので通常は原因ディスクの消去I /...