持つ必要があります バイオインフォマティクス のために Linux

ProteinShopは、タンパク質の構造を操作するための対話型ツールです。それはすぐに人間の知識と直感を用いてタンパク質構成のセットを作成するために設計されました。これらの構成は、ローカルまたはグローバルな最適化を行うことができます。...

pyNetConvは、一部のネットワーク·ファイル·フォーマットの変換を支援するために作成したPythonライブラリです。バージョン0.6以来、pyNetConvは、次のファイル形式を読み書き（およびから/への変換）することが可能です。...

Pysamは読書とSamfilesを操作するためのPythonモジュールは＆NBSP;それはsamtools C-APIの軽量ラッパーです。クイックスタートガイドはこちらです。より詳細なドキュメントは、こちらをご覧ください。質問やコメントは大歓迎ですとhttp://groups.google.com/group/pysam-user-groupWhatでpysamユーザーグループに送信する必要があります。このリリースで： samtools 0.1.8とTABIXサポートします。 の要件の ...

PySCeS分子細胞生理学＆NBSPトリプル-Jグループによって開発されたプロジェクトであり、順番にモデルを試してみて、生きた細胞を構成する複雑なプロセスとシステムを理解するために、 の特長の ...

reciprocal_smallest_distanceは、グローバル配列アラインメントと配列間の最大尤進化距離を正確にゲノム間の相同分子種を検出するために使用してペアワイズオルソロジーアルゴリズムです。のtarアーカイブからのインストールのダウンロードして、githubのから最新バージョンを解凍します：CD〜カール-L...

RFLPプランナーは、RFLP実験を計画するのに役立つツールです：それは、様々な方法でホモログのDNA配列のセットを切断する制限酵素を検出し、得られたゲル -...

このシールは、Hadoopの上の配列アラインメントを提供するPythonモジュールである。シールは、生物学的な配列アラインメントのためのMapReduceのアプリケーションです。 Pydoop（http://pydoop.sourceforge.net）、HadoopのためのPythonのMapReduceとHDFS APIを介してのHadoop（http://hadoop.apache.org）上でそれを実行ます。 の要件の ...

seriesoftubesのSolexaチップ-seqのデータの拡張パイプラインである。パッケージのドキュメント ...

makeに似たシステムを構築し、頻繁に例えば複雑なワークフローを作成するために使用されているバイオインフォマティクスにおける＆NBSP; snakemakeは一緒に、高速で快適な実行環境で、Pythonのスタイルで清潔でモダンドメイン固有の仕様言語（DSL）を提供することで、ワークフローを作成するの複雑さを軽減することを目指しています。インストールの - ...

SSuMMoは分類群にシーケンスを割り当てるためにHMMERを使用して反復的に周りに設計された関数のライブラリです＆NBSP;結果は、非常にそのコミュニティ内の種/属の分布を示す木をアノテートされています。ソースコードに含まれているプログラムは、ツールへのものがあります - - 隠れマルコフモデルの階層型データベース構築 - dictify.pyを。 - 分類学上の名前を認識するようにシーケンスを割り当てる - SSUMMO.pyを。 - シンプソン、シャノン＆その他methods-...