持つ必要があります バイオインフォマティクス のために Linux

ハゼは、バイナリデータファイルを読み取るためのPython...

HTSeqは、ハイスループットシークエンシング（HTS）アッセイからのデータを処理し、分析するためのPythonのフレームワークです。 の要件の：ます。 <...

Jmolは、もともと3D化学構造の分子ビューアとして機能するように設計されたオープンソースのクロスプラットフォームでフリーなグラフィカルソフトウェアです。 HTML5...

関数lsimは、巨大分子の電子密度を重畳し、構造的な類似性スコアを計算します。その計算は、比較される分子のサイズに伴って直線的に拡張します。関数lsimアラインメントは、生化学的、構造要素と概念的に無関係であり、したがって、構造のみのタンパク質の類似研究のために、公正かつ適切です。インストール：配布ファイルを解凍します。タール-xzvf関数lsim-linux.tar.gzファイルのディレクトリに移動します。CDのlsim.1.0.0コピー、移動、またはリンクする実行可能ファイルの関数lsimを適切な場所に...

MacMolPltは3-D分子構造と通常モード（振動）をプロットするための現代のグラフィックプログラムです。現代の手段：...

このMACS2は、ChIPの、配列データのためのモデルベースの​​分析ツールである。配列決定技術の向上に伴い、ハイスループットシークエンシング（チップ配列）に続いてクロマチン免疫沈降は、ゲノムワイドなタンパク質-DNA相互作用を研究するために人気を集めている。強力なChIP配列分析法の欠如に対処するために、我々は、結合部位の転写因子を同定するために、ChIPの-配列（MACS）のモデルベースの​​分析という新規なアルゴリズムを提示する。...

massXpert質量分析パッケージは、線形（バイオ）ポリマーのための質量分析の環境があります。それはクロスプラットフォーム開発環境にそのプロジェクトのポートであるように、それは、GNUのpolyxmassのすべての技術革新を継承します。 このリリースの新機能：XpertMinerで...

MetagenomeDBを簡単メタゲノム配列を格納、取得、および注釈付けするように設計されたPythonのライブラリです＆NBSP;のMongoDBデータベースの上に抽象化レイヤとしてMetagenomeDB作用します。これは、2つのタイプのオブジェクト、すなわち配列やコレクションを作成および変更して接続するためのAPIを提供します。＆NBSP; *シーケンス（順序クラス）とすることができる読み込み、コンティグ、PCRクローンなど＆NBSP;...

MISO（アイソフォームの混合物）の発現レベル＆NBSPを定量Pythonで書かれた確率的なフレームワークであり、RNA-配列データから選択的スプライシングされた遺伝子のうち、およびサンプルの間で示差的に調節アイソフォームまたはエクソンを識別します。RNA-配列におけるアイソフォームから生成される読み取ることで生成的なプロセスをモデル化することにより、MISOモデルは、読み込みが特定のアイソフォームに由来する確率を計算するためにベイズ推論を使用しています。MISOは、選択的mRNAアイソフォームの基本的なセ...

mpiBLASTは、NCBI BLASTのMPIベースの並列実装です。プロジェクトはのformatdbを交換し、インストールMPIとコンピュータのクラスタ上で並列にBLASTのジョブを実行バージョンでblastallがプログラムのペアで構成されます。伝統的なBLAST対mpiBLASTを使用するには、主に2つの利点があります。まず、mpiBLASTは、クラスタ内の各ノード全体でデータベースを分割します。データベースの各ノードのセグメントは小さいので通常は原因ディスクの消去I /...